Viz též Menu, Konfigurace systému a používané soubory
Program SeqAn je konfigurován jako COM server. Jeho základní funkce (nastavení, načtení dat pro analýzu) lze ovládat automaticky z prostředí IsoEnz. Propojení na program SeqAn je možné docílit použitím následujících položek menu Zpracování
SeqAn data pro konkrétní gel budou načtena v programu SeqAn.
SeqAn + transformace dat provede akce jako v předchozím případě a navíc vypočítá transformaci dat podle údajů zapsaných v databázi.
SeqAn + načtení tříd provede akce jako v předchozím případě včetně případné transformace dat, provede rozdělení hodnot do klasifikačních tříd a pro nastavené třídy vypočte základní statistiky.
Do programu SeqAn jsou načítány ty záznamy z tabulky hodnot (T3), které (vzhledem k vazebním podmínkám) odpovídají právě aktivnímu záznamu tabulky gelů (T2). Jména atributů tabulky hodnot (T3), přes které je provedena vazba na tabulku gelů (T2), musí být uvedena v položce SeqAnField u Nastavení databáze (viz Konfigurace systému a používané soubory), přičemž jména atributů se oddělují znakem středník. Není-li položka SeqAnField v nastavení přítomna, objeví se dialog pro výběr těchto atributů. Současně je potřebné, aby příslušné podmínky byly přítomny v seznamu vazebních podmínek (vazba nemusí být aktivní).
Program SeqAn provádí vyhodnocování gelů s údajem o minimální směrodatné odchylce. Pokud je směrodatná odchylka hodnot zařazených do určité třídy vyšší nežli tato limitní hodnota, pak je možné uvažovat o dalším rozdělení dané třídy na podtřídy. Tyto limitní hodnoty jsou specifické pro jednotlivé enzymy. Je tedy užitečné je zadávat automaticky z programu IsoEnz v rámci volání programu SeqAn. Pro tento účel je potřebné, aby existovala zvláštní tabulka se seznamem zpracovávaných enzymů, která bude provázatelná s tabulkou gelů (T2) přes kód (jméno) enzymu. Jedním z atributů této tabulky musí být hodnota minimální směrodatné odchylky. V rámci nastavení parametrů databáze (viz Konfigurace systému a používané soubory) je potřebné zadat následující položky:
Enz_T |
číslo tabulky s obecnými daty o zpracovávaných enzymech. |
Enz_RelField |
Jména polí (seznam oddělený znakem "|" [vertikála]) pro svázání tabulky T2 (údaje o gelech a tabulky enzymů (tabulka s číslem Enz_T). |
Enz_ValField |
Jméno pole tabulky enzymů s hodnotou minimální směrodatné odchylky (reálné číslo). |
Do příslušného záznamu v tabulce gelů (T2) je možné zapsat základní výsledky zpracování gelu ve formě textu. Přitom je využíváno specifikovaného memo pole. Má-li být tento zápis prováděn, je potřebné v Nastavení databáze mít též specifikován parametr SeqAnOutput s hodnotou, kterou je jméno atributu pro zápis tohoto memo pole. Tento zápis výsledků zpracování konkrétního gelu je využíván pro opakované načtení dat včetně jejich opakovaného vyhodnocování pomocí příkazů SeqAn + transformace dat nebo SeqAn + načtení tříd.