Viz též Databáze - zálohování, Propojení s programem SeqAn, Porovnání více gelů
Chování programu, nastavení vlastností databáze a některé další prvky jsou ukládány do několika standardních textových souborů:
IsoEnz.ini - určuje základní nastavení programu IsoEnz (viz níže).
tables.sql - obsahuje skript pro vytváření nové databáze (tento soubor je použit vždy, pokud je vytvářena kompletní nová databáze se všemi tabulkami - obsahuje SQL příkazy pro tvorbu těchto tabulek a případných indexních souborů v prostředí programu IsoEnz).
IsoEnzDB.ini - určuje základní konfiguraci používané databáze (viz níže).
IsoEnzDB.mdl - do tohoto souboru se zapisují všechny základní vazební podmínky mezi všemi tabulkami databáze; pokud existuje, tak je automaticky načten vždy při otevírání databáze.
*.mdl - uživatel může zapsat i další sady vazebních podmínek (například pro jiné pohledy na danou databázi).
[jméno_tabulky].def - zaznamenává pojmenování atributů v dané tabulce.
[jméno_dotazu].sql - obsahuje SQL příkaz SELECT pro daný dotaz.
Změny je možné provést pomocí menu System > Nastavení.
Umístění: Soubor IsoEnz.ini uložený v instalačním adresáři programu. Obsahuje základní nastavení, které se vztahuje k jakékoli používané databázi.
Základní hodnoty:
Database - Adresář s používanou databází
NameWidth - šířka pole v pixelech pro označení jména atributu v tabulce (má vliv na šíři sloupců s check-boxes na všech listech aplikace IsoEnz)
ItemWidth - šířka v pixelech editačních boxů (společně pro všechny listy aplikace IsoEnz)
MaxHeight - Výška v pixelech každého editačního pole typu MEMO (společně pro všechny listy aplikace IsoEnz)
Další přípustné parametry jsou uvedeny v kapitole Databáze - zálohování.
Viz příklad souboru nastavení programu IsoEnz.ini.
Změny je možné provést pomocí menu System > Nastavení.
Umístění: Soubor IsoEnzDB.ini uložený v adresáři databáze. Obsahuje základní informace o databázi, například seznam tabulek databáze, jejich pojmenování, uživatelsky definované dotazy a jiné.
Základní hodnoty:
Tables - Celkový počet tabulek. Minimálně je potřebné, aby databáze obsahovala čtyři základní tabulky (Table0 až Table3).
Table0 - Jméno první tabulky (jméno příslušného souboru včetně koncovky; pokud je soubor umístěn přímo v adresáři databáze, pak by cesta neměla být uvedena). Soubory tabulek jsou číslovány vždy od 0, tedy postupně Table0, Table1, Table2, ...
Page0 - Pojmenování tabulky 0, které se objevuje jako jméno příslušného listu aplikace. Obdobně hodnoty pro další tabulky/listy.
ImageField - Jméno atributu tabulky 2, kde je zapisován údaj o jménu souboru s obrazem naskenovaného gelu
SeqAnField - Jména atributů tabulky 3, které slouží pro identifikaci gelu pro zpracování příslušných hodnot programem SeqAn. V případě více atributů jsou tyto odděleny středníkem.
UserQueries - Celkový počet uživatelsky definovaných dotazů.
UserQuery0 - Jméno prvého souboru *.sql s uživatelsky definovaným dotazem (SELECT). Příslušný dotaz je možné v programu provést pomocí dané položky menu Dotazy.
Další parametry jsou uvedeny v souvislosti se zpracováním dat v kapitolách Propojení s programem SeqAn, Porovnání více gelů, Generovat skupinu gelů a Databáze - zálohování.