Jak vyhodnotit alelické frekvence v populaci

Viz též Menu, Vyhodnocení alelických frekvencí

 

Před vlastním zpracováním je potřeba data připravit v podobě Browse buď jako pohled na zpravidla část příslušné tabulky (za použití vhodných vazebních podmínek) nebo jako dotaz nad databází). Možné je též zpracovat data uložená ve volné tabulce (samostatný soubor *.dbf nebo *.db nezařazený do databáze IsoEnz).K otevření takové tabulky je nutno použít příkaz menu Zpracování > Tabulka mimo databázi. Tímto způsobem je možno opakovaně zpracovat již jednou připravená a uložená data všech jedinců v populaci.

Okno Zpracování alelických frekvencí je průvodcem pro vyhodnocení dat. Okno vyvoláme z menu  Zpracování > Alelické frekvence. Na okně je několik záložek, které postupně procházíme pomocí tlačítka Další >>. K návratu na předchozí krok můžeme použít tlačítko << Předchozí.

 

Záložka Zdroj dat slouží k výběru otevřeného zdroje dat.

alel1.png

 

Záložka Výběr proměnných je určena pro definování jednoho nebo více atributů k jednoznačné identifikaci jedince v populaci a pro výběr atributů se zpracovávanými daty (s alelickými kombinacemi pro jednotlivé enzymatické lokusy). Výběry se provádí z příslušných dvou seznamů.

alel2.png

 

Záložka Kontrola dat slouží pro kontrolu vstupních dat: každý jedinec může totiž být representován pouze jediným záznamem ve vstupní datové tabulce. Postupně jsou procházeni všichni jedinci ve vstupní datové tabulce a jsou zobrazováni ti jedinci, kterým odpovídá více záznamů. Uživatel pro každého takového jedince musí vybrat jediný záznam, který v datech ponechá a ostatní záznamy je potřeba vymazat pomocí tlačítka Delete. V průběhu práce je možné záznamy editovat.

Poznámka: Vstupní datová tabulka vzniká kopií příslušných údajů ze vstupních dat. Jakékoli změny prováděné na záložce Kontrola dat se tedy zpětně nepromítají do vstupních dat, nejsou tedy zapisovány do databáze programu IsoEnz.

alel3.png

 

Zobrazit všechna data je možné pomocí tlačítka Zobrazit vše. Potom je možno tato data uložit pro další (i opakované) zpracování - k tomu slouží tlačítko Uložit. Přejít zpět na kontrolu dat je možné tlačítkem Kontrola.

alel4.png

 

Záložka Zpracování obsahuje tlačítko Analyzovat pro provedení vlastních výpočtů pro všechny vybrané enzymy (enzymatické lokusy). Pomocí tlačítka Diversity je možno vypočítat indexy genetické diversity populace. Textový výstup je prováděn do příslušného okna, z něhož je možno všechny údaje kopírovat do schránky Windows pomocí tlačítka Kopírovat.

alel5.png