Information and data systems
Zpracování informačních a datových systémů

Tyto stránky se zabývají především problematikou soustředěnou na hlavní obory v nichž působí firma IDS - aplikované informační systémy, zpracování dat, programování, studium biologie a ekologie, které je rozvíjeno v návaznosti na aplikace v lesnictví, ochraně přírody, v lékařství a v dalších oborech. Při zájmu o ostatní oblasti činnosti nás kontaktujte.
 
Aktuálně: Koronavir SARS-CoV-2 a onemocnění COVID-19
 
Hlavní kapitoly na této stránce
Ekologie
Šumava: ekologie a ochrana přírody
Seminář Lesník 21. století
Software a zpracování dat
 
 
Některé nejnovější články tohoto webu
12. 5. 2020 Management recommendations according to Management Sets and Sub-sets
3. 1. 2020 Používané charakteristiky počasí ke konci roku 2019 na meteorologických stanicích ČHMÚ
14. 9. 2019 Vitality and counts of Pedicularis sudetica subsp. sudetica
14. 11. 2018 Sukcese vegetace na opuštěných polích v oblasti Chelčic (jižní Čechy)
16. 10. 2018 Vegetace v povodí Plešného a Čertova jezera v období 2007 až 2018
16. 10. 2018 Lesy výškového transektu na Plechém (Šumava) po deseti letech
16. 10. 2018 Ukázkové a výzkumné plochy pro sledování vlivu managementu v lesích chráněných území v roce 2018
16. 10. 2018 Struktura stromového patra a světelné poměry v porostech na výzkumných plochách
16. 5. 2018 Vliv počasí na kvalitu semen borovice lesní a smrku ztepilého
13. 2. 2018 Nové a přehlížené matematicko-statistické metody pro geobiocenologii a ekologii
19. 10. 2017 Multivariate analysis for assessment of the tree populations based on dendrometric data ...
25. 5. 2017 Sucho na stanici Churáňov od roku 1962
6. 12. 2016 Altitudinal variability and diversity in the grassland communities of the Eastern Giant Mts.
30. 11. 2016 Communities of epigeic beetles in tree line from montane spruce forest to secondary meadow in the different stage of the forest decline in the area of Modrava
6. 10. 2016 Sledování vegetace v povodí Plešného a Čertova jezera do roku 2016
10. 7. 2016 Genetic structure of spruce population and forest management
22. 6. 2016 Obyvatelstvo území Šumavy - proč zde uchovat národní park?
21. 6. 2016 Počasí na Churáňově v roce 2015
28. 4. 2016 Katalog pěstebních opatření pro zvýšení biodiverzity v lesích v chráněných územích
27. 4. 2016 Ukázkové a výzkumné plochy pro sledování vlivu managementu v lesích chráněných území
25. 4. 2016 Studium struktury společenstev epigeických brouků na výzkumných plochách
25. 4. 2016 Vliv pěstebních opatření na strukturu společenstev makromycetů na vybraných výzkumných plochách lesů
20. 4. 2016 Společenstva půdních pancířníků v lesích chráněných území s různým managementem
17. 12. 2015 Vliv asanačních zásahů v oblasti Ptačího potoka (NP Šumava) po čtyřech letech
29. 10. 2015 Pramen Vltavy nevyschnul
27. 4. 2015 Zkušenosti s plánováním péče o CHÚ ve vztahu k lesům. Jak se přistupuje k otázce biodiversity v rámci ochrany přírody?
15. 4. 2015 Disturbance-induced changes in the plant biomass in forests near Plešné and Čertovo Lakes
27. 2. 2015 Vlastnosti půdy a struktura lesního ekosystému ve vztahu k jeho dynamice
27. 2. 2015 Společenstva mnohonožek a stonožek v měnících se podmínkách ...
Seznam novinek viz též Informace o webu infodatasys.cz
 
Užitečné upozornění:
Pokud jste opakovaně návštěvníky těchto stránek a zajímáte se o to, jaké dokumenty byly přidány nebo změněny v poslední době, použijte možnost Hledat soubor na tomto webu. Poté v poli Datum poslední aktualizace vyplňte datum, od něhož chcete změny vyhledat. Po potvrzení tlačítkem Hledej bude vygenerován seznam příslušných souborů.

Pokud máte problém se zobrazením těchto stránek v MS Internet Explorer, zvláště dochází-li k chybě při otevírání souborů pdf v okně IE, pak je pravděpodobné, že tato chyba bude odstraněna užitím originálního nastavení, které je možné provést pomocí nástroje na webu společnosti Microsoft - Obnovení nastavení aplikace Internet Explorer .

Main picture

Obsah těchto stránek je průběžně upravován. Máte-li zájem o zjištění těch dokumentů, které byly v poslední době přidány nebo upraveny, můžete využít funkci Hledat soubor na tomto webu. Tam stačí vyplnit pouze datum, od kdy má být hledání provedeno. Výsledkem tak bude seznam dokumentů aktualizovaných či přidaných mezi zadaným dnem a současností.

V březnu 2020 uplyne již 25 let, co je tu firma IDS. Za tu dobu byla zpracována řada projektů a tiskem vyšlo více jak 120 publikací - článků i samostatných knih. Založeny byly rovněž tyto webové stránky, které sdružují přes 400 článků a ještě více dalších dokumentů, na jejichž přípravě se podílela jak firma IDS, tak více než 240 spolupracovníků, jímž patří poděkování.
Stejně, jako se mění používané technologie, vyvíjí se i pracovištěm IDS nabízené služby. Tento vývoj můžete sledovat prostřednictvím stránek domény infodatasys.cz. Tato doména informuje o výsledcích práce firmy IDS od roku 2003. Od roku  2011 je zde zaznamenáno průměrně více jak 2 tisíce návštěv ročně. Více se můžete dovědět v kapitole Služby.
 
Začátek stránky

Ekologie

Upozornění na možnost šíření lýkožrouta smrkového v horských lesích ČR
Vzhledem k abnormálnímu průběhu počasí ve střední Evropě v roce 2015 existuje zvýšená pravděpodobnost gradace lýkožrouta smrkového (Ips typographus) ve smrkových horských (klimaxových) lesích ve 2 až 3 následujících letech. Podrobnosti viz článek Počasí na Churáňově v roce 2015. Toto upozornění bylo vydáno v průběhu roku 2015. Ve skutečnosti byla poté masivní gradace zaznamenána v lesích ČR zvláště od začátku vegetační sezóny 2018, což přesně odpovídá předchozímu upozornění. Vzhledem k průběhu počasí v roce 2018, zvláště s ohledem na vysoké teploty vzduchu a nízké úhrny srážek, nelze předpokládat, že gradace lýkožrouta v nejbližších letech skončí. To potvrdil i rok 2019.

Porovnání pětidenních klouzavých průměrů teplot na stanici Rudolfov od roku 2014 do současnosti. Patrné jsou extrémně vysoké hodnoty průměrů v roce 2015. V roce 2018 se jednalo o výrazné snížení teplot v předjaří (březen), po němž následovalo naopak nebývalé zvýšení teplotních průměrů (duben-květen), které znamenalo náhlé urychlení růstu vegetace a současně i urychlení vývoje lýkožrouta smrkovéhého, k jehož dalšímu množení přispěly relativně vysoké letní teploty provázené nedostatkem srážek od začáku roku 2018. Podrobnosti viz Výsledky měření počasí na stanici Rudolfov.

Porovnání pětidenních klouzavých průměrů vlhkosti vzduchu na stanici Rudolfov od roku 2014 do současnosti. Extrémní sucho bylo patrné v roce 2018 především v létě (do začátku září). V roce 2019 vidíme vysokou variabilitu vzdušné vlhkosti v dubnu, naopak z hlediska května patří rok k relativně vlhkým. Podrobnosti viz Výsledky měření počasí na stanici Rudolfov.
Sucho se v roce 2018 projevuje v různé míře v různých částech České republiky, projevy se liší též podle jednotlivých lokalit. Přestože Šumava a její podhůří patří k vlhčím regionům, extrémní projevy je možné vidět v lesích oblasti Sušicko-Horažďovických vápenců. Na propustných půdách poblíž obce Čepice se společenstvy asociace Cephalanthero-Fagetum se sucho projevuje předčasným hnědnutím a opadáváním listů buku.
Meteoradar ČHMÚ
Klima v ČR
To, jak se dlouhodobě vyvíjí klima v České republice, je patrné z vyhodnocení Vývoj teplot a srážek v ČR od roku 1961. Článek Globální gradienty teploty v České republice a diferenciace regionů se věnuje vyhodnocení rozdílů průměrných teplot vzduchu v různých regionech ČR. Pro tento účel využívá moderní geostatistické metody. Viz též ostatní články v sekci Klima
Historické změny krajiny
V posledních letech byla věnována pozornost vyhodnocení historických změn krajiny a vlivu historie užití země na současnou krajinou diversitu. Současně byly zpracovány mapy stabilního katastru pro řadu obcí České republiky. Výsledky těchto prací jsou dostupné v sekci Krajinná ekologie a historie krajiny.
 
Začátek stránky

Šumava: ekologie a ochrana přírody

Výzkum na Šumavě je průběžně doplňovanou sekcí, kde jsou soustředěny materiály ke stavu přírody v tomto pohoří. Vzhledem k bouřlivé diskusi týkající se přístupu k horským lesům Národního parku Šumava byl sepsán článek pro časopis Šumava, který shrnuje aktuální poznatky ve formě dostupné i pro širší veřejnost - 1. díl a 2. díl.
Aktuality ochrany přírody na Šumavě
Aktuality ochrany přírody na Šumavě obsahují soubor dokumentů k aktuální situaci v Národním parku Šumava. Mezi dokumenty je uveden i dříve diskutovaný návrh zákona o Národním parku Šumava a rozbor navrhované nové zonace NPŠ. Přestože je v současnosti projednávána velká novela zákona 114/1992 Sb., kde má být komplexně řešena problematika národních parků v ČR, je stále potřebné připomínat, na minulé snahy, které mohly vést k ohrožení chráněného území na Šumavě (a nejen tam).
Asanační zásahy u Ptačího potoka
V roce 2015 uplynuly již čtyři roky od okamžiku, když v oblasti Ptačího potoka na Modravsku v centru NP Šumava proběhly rozsáhlé asanační zásahy proti lýkožroutu smrkovému. Proto nastal čas si tuto situaci znovi připomenout a zjistit, jaká je aktuální situace. Primární informace byly podány v dokumentu Posouzení aktuální situace v oblasti Ptačího potoka v NP Šumava, který ukázal na škodlivost zásahů. Jedná se o exemplární příklad poškozování předmětu ochrany v národním parku, přičemž opatření nedokáží naplnit ani deklarovaný cíl - ochranu okolních lesů proti gradaci lýkožrouta smrkového. Dokument byl použit jako podkladový materiál při podání podnětu České inspekci životního prostředí, která na základě svého šetření udělila Správě Národního parku a CHKO Šumava pokutu - viz například článek na serveru novinky.cz ze dne 27. 8. 2012. Účelovost takzvaných asanačních těžeb v cenných územích Národního parku dokládá příkaz ředitele Správy NPŠ ze dne 17. 10. 2012, který ukládá přiblížení a následnou expedici dřeva hmoty ponechané k zetlení. Nejedná se tedy o boj s lýkožroutem, ale o těžbu pro zisk. Protiprávnost jednání Správy NPŠ a Policie ČR potvrdil též Krajský soud v Plzni svým rozsudkem z 11. 12. 2013.
Stav lokality v roce 2015 je nově popsán v článku Vliv asanačních zásahů v oblasti Ptačího potoka (NP Šumava) po čtyřech letech, který dokazuje správnost dřívějších závěrů o škodlivosti asanačních těžeb.
Porovnání vlivu aktivního a pasivního managementu na stav a vývoj horské smrčiny umožní zvolit vhodný přístup k hospodaření v horských lesích při výskytu lýkožrouta smrkového v případě, že v území existuje předmětný zájem ochrany přírody.
Recenze
Dezinterpretace údajů z území ponechanému spontánnímu vývoji na Šumavě může vést ke zneužití v rámci současného boje o takzvanou bezzásahovost na území Národního parku Šumava, jak ukazuje recenze na Vicenův text k oblasti Židovského lesa (Roklanského lesa).
 
Kniha Kindlmann P., Matějka K., Doležal P.: Lesy Šumavy, lýkožrout a ochrana přírody (326 stran, ISBN 978-80-246-2155-5) vyšla v nakladatelství Karolinum v roce 2012, kde ji je možno objednat.
Základní informace z knihy byly vybrány do souhrnu, který je dostupný ve formě brožury. Kniha vychází z výsledků dlouholetého výzkumu ekosystémů v území Šumavy i dalších pohoří Střední Evropy.
 
Šantrůčková, Vrba et al.
V roce 2010 byla vydána kniha Šantrůčková H., Vrba J., Křenová Z., Svoboda M., Benčoková A., Edwards M., Fuchs R., Hais M., Hruška J., Kopáček J., Matějka K., Rusek J.: Co vyprávějí šumavské smrčiny. Průvodce lesními ekosystémy Šumavy. Vydala Správa NP a CHKO Šumava ve spolupráci s Přírodovědeckou fakultou Jihočeské Univerzity a s Českou společností pro ekologii. Publikace se pokouší vysvětlit řadu mýtů a omylů týkajících se horských (klimaxových) smrčin tak, aby byl obsah srozumitelný i širší, poučené veřejnosti. Vychází z moderních poznatků o dynamice klimaxových smrčin, která je odlišná od dynamiky smíšených lesů rostoucích v nižších nadmořských výškách.
Kniha je v současnosti u distributorů rozebrána. Je též dostupná ve formátu pdf ke stažení - Otevřít PDF (cca 36 MB).
 
Začátek stránky

Seminář Lesník 21. století - most mezi ekologií lesa a potřebami společnosti

15. ročník - Co mohou říci poznatky z národních parků k současné lýkožroutové kalamitě v hospodářských lesích ČR za podmínek probíhající klimatické změny
Poslední ročník seminářese uskutečnil 24. října 2019, opět v Kašperských Horách. Věnoval se aktuálním otázkám změny klimatu a jak se ta projevuje v lesních ekosystémech v ČR, speciální pozornost pak byla věnována disturbancím v důsledku rozsáhlé kůrovcové kalamity. Ta je především důsledkem stresu vyvolaného sníženou dostupností vody (suchem) a vysokými teplotami. Jediným dlouhodobým řešením této situace je změna druhové skladby lesů, tedy minimalizací pěstování smrku ztepilého v polohách 1. až 4. lesního vegetačního stupně.
Sborník k semináři, přehled příspěvků a presentace
 
14. ročník - Pralesy a jejich vnímání společností
Seminář uskutečnil 26. dubna 2018 v Kašperských Horách, kde se diskutovalo o problematice pralesů.
Rok 2018 byl Správou Národního parku Šumava vyhlášen rokem pralesů. Prales je termín, který si zaslouží upřesnění jeho obsahu a to i ve vztahu k dalšímu, často používanému termínu divočina. S vymezením termínu prales velmi úzce souvisí vysoký stupeň přirozenosti lesa. Potřebné je věnovat se uchopení pralesů z hlediska jak přírodovědného a lesnického, tak sociálního, estetického, etického a ekonomického. Co přináší znalost pralesů pro úspěšný management hospodářských lesů a zacházení s jinak převážně kulturní krajinou?
Sborník k semináři, přehled příspěvků a presentace
 
13. ročník - Krušné hory a Šumava - pohoří pod různým vlivem člověka
13. ročník semináře se konal 23. března 2017 v Informačním centru NP Šumava v Kašperských Horách.
Program:
Sborník ze semináře Lesník 21. století - 13. ročník - 2017
 
12. ročník - Příroda v zákonech
12. ročník semináře se konal 19. května 2016 v Informačním centru NP Šumava v Kašperských Horách.
Sborník ze semináře Lesník 21. století - 12. ročník - 2016
Program:
 
11. ročník
11. ročník semináře proběhl na Šumavě ve Stachách dne 26. 2. 2015. Tentokrát byl věnován struktuře lesa, vlastnostem půdy a vodě. Mimo jiné byly předneseny následující příspěvky.
Sborník ze semináře Lesník 21. století - 11. ročník - 2015
 
Začátek stránky

Software a zpracování dat

*

TextSearch - funkcionalita, kterou jinde nenajdete

V současnosti je testována úplně nová funkce programu TextSearch - hledání podle podobnosti textů. Běžné literární databáze umožňují vyhledání položek například podle autorů, klíčových slov, či dalších pevně zadávaných polí. Nejnovější verze programu TexSearch, která je v současnosti testována, však dokáže vyhledat položky, které jsou nejpodobnější právě zadanému textu. Existuje tedy možnost vyhledat publikace, které s vysokou pravděpodobností tématicky souvisí s určitou publikací nebo s libovolným textem - mapříklad s tím, který právě píšete Vy. Takovou podobnost je možno využít i pro klasifikaci souboru publikací: může se tedy ukázat, že daný soubor se tématicky rozpadá na několik skupin. Příkladem může být klasifikace 58 ekologicky zaměřených článků publikovaných v časopise Journal of Forest Science, ročník 64-65 (po číslo 4). Nejenže odpadá pracnost takového třídění publikací, ale výsledek je podepřen objektivní statistikou. Viz též popis programu.
*

FotoOverlay je aplikace pro zpracování měřických snímků - mikrofotografií

Typickým příkladem takových snímků jsou digitální fotografie z mikroskopu. Program umožňuje nejen jednoduché měření délky a počítání objektů ve snímku, ale i provedení překryvu několika snímků ze dvou i více rovin zaostření. Podrobně jsou funkce programu popsány v nápovědě. Vzhledem k tomu, že program umožňuje jednoduché propojení se systémem TextSearch či s prohlížečem IDS ViewImages, může uživatel současně vytvářet rozsáhlé databáze digitálních snímků, které mohou být popsány volitelnou řadou atributů.
Termín měřický snímek byl převzat z fotogrammetrie, kde se nejčastěji používá pro označení leteckých měřických snímků, tedy fotografií se středovým průmětem, u nichž velikost pixelu (respektive velikost území odpovídajícího tomuto pixelu) je proměnná podle polohy na snímku. Zpracováním těchto fotografií vznikají takzvané ortofotomapy, tedy snímky s ortogonálním průmětem, kde velikost pixelu je nezávislá na jeho poloze. Program FotoOverlay přistupuje k mikrofotografiím stejně, jako by se jednalo například o ortofotomapy, pouze s jiným měřítkem.
Tento program může být jednoduchou a levnou volbou umožňující práci s řadou funkcí, které jsou běžně užívány například prostřednictvím programů NIS Elements, OLYMPUS Stream nebo QuickPHOTO (měření ploch, délek, počítání objektů, překryv více snímků z různých rovin zaostření, práce s databází snímků a další), které jsou běžně používány například s mikroskopy Nikon a Olympus.

DataCollector - aplikace pro sběr dat je k dispozici

Uživatelé pořizující rozsáhlé soubory dat například z dotazníkových šetření stojí před úkolem, jak převést sebrané údaje do datové podoby. Pro tento účel jsou nejčastěji používány takové aplikace jako MS Excel, což však přináší řadu nevýhod. Jednou z nich je vysoká pravděpodobnost zápisu chybných údajů, protože sebrané údaje je potřeba nějakým způsobem kódovat. Programy jako MS Excel totiž dovolí do pole zapsat jakoukoli hodnotu. Proto se zpracovatelům dat často stává, že například v poli, kde mají být pouze číselné údaje, jsou nalézány i údaje textové, kód může být zapsán do neodpovídajícího pole atd. Proto byla vyvinuta nová aplikace DataCollector, která dokáže zajistit správné kódování údajů, které zapisuje do databázové tabulky.
Více ...
 

* Beta verze programu pro přípravu rejstříků na základě dokumentu ve formátu PDF je nyní k dispozici. Tento program je použitelný například v předtiskové přípravě publikací. Byl užit pro generování rejstříků pro knihu Kindlmann P., Matějka K., Doležal P.: Lesy Šumavy, lýkožrout a ochrana přírody.

* Zpracování skenovaných map s barevnou legendou
Zpracování mnoha tištěných map je problematické v případě, že se jedná o mapu, kde jsou plochy k položkám legendy přiřazeny pouze pomocí barvy. Pokud legenda obsahuje větší množství položek, pak může být obtížné odhadnout, jaká plocha odpovídá jaké položce legendy. Tento problém je možno řešit v programu PlotOA, který v nejnovější verzi umí automaticky přiřadit odpovídající položku barevné legendy. Předpokladem je naskenování mapy a její transformace do určitého souřadného systému, přičemž se může jednat i o zcela abstraktní souřadný systém.
* GIS: výpočet indexů z DEM
Program PlotOA dokáže nově počítat různé indexy na základě digitálního modelu terénu (DEM). Tyto výsledky mohou být využity například pro interpretaci ekologických gradientů v terénu či pro mapování vegetace (viz vytvořený model lesních vegetačních stupňů).
Frey et al.
Mechorosty Evropy
V současnosti je připravena databáze platných jmen mechorostů Evropy podle publikace Frey W., Frahm J.-P., Fischer E., Lobin W., Blockeel T.L. (2006): The Liverworts, Mosses and Ferns of Europe. Harley Books, Essex. Samozřejmostí je zahrnutí všech uváděných synonym do databáze, což umožní i vyhledávání platných jmen mechorostů odpovídajících těmto synonymům. Tato databáze je dostupná s novou verzí programu SpeciesNames, která umožňuje přepínání mezi různými slovníky jmen, uživatel může též editovat slovníky stávající nebo připojit slovník vlastní. Zlepšena byla komunikace s jinými programy, což se týká zvláště nové verze programu DBreleve.
 
Databáze jmen cévnatých rostlin Evropy
Pro program SpeciesNames je k dispozici databáze jmen podle klasického díla Flora Europaea - viz dostupné databáze.

Zkontrolujte vámi používané verze software s verzemi aktuálně nabízenými. Nemáte nárok na bezplatný upgrade? Pokud tomu tak je, pak proveďte download příslušného instalačního souboru zde a vlastní instalaci.
Upozornění: Uživatelé starších produktů (CD pořízené před datem 1. ledna 2011), jejichž součástí je prohlížeč vTextSearch mohou nyní získat ZDARMA jejich novou verzi. Stačí, aby na adresu uvedenou v sekci kontakt zaslali legálně pořízený kompaktní disk s žádostí o jeho výměnu (nezapomeňte uvést zpáteční adresu).

Windows 10 Windows 8 Windows 7
Všechny poskytované aplikace jsou postupně testovány pod uvedenými operačními systémemy.

 

Publikované materiály na www.infodatasys.cz jsou optimalizovány pro prohlížeče MS Internet Explorer a Google Chrome, jejich kontrola byla provedena též některými dalšími programy. Na těchto stránkách jsou uvedeny též materiály ve formátu PDF, k jejichž prohlížení je doporučen Adobe Acrobat Reader - ten je možné získat zdarma na internetové adrese firmy Adobe
Poslední aktualizace obsahu těchto stránek ke dni 9. 8. 2020
3.8.2020 Meteorologická stanice Rudolfov (doplněno)
2.8.2020 Aktuální počasí na Šumavě - stanice Churáňov (doplněno)
3.7.2020 Nová verze programu DBreleve
22.3.2020 Nápověda a popis programu CanopyPhotos: zpracování hemisférických snímků
4.2.2020 Nová verze programu FotoOverlay
4.2.2020 Nová verze programu TextSearch
25.10.2019 Materiály k semináři Lesník 21. století, 15. ročník
14.9.2019 Seznam publikací, ... (aktualizováno)
22.2.2019 Nová verze programu PlotOA
14.11.2018 Sukcese vegetace na opuštěných polích v oblasti Chelčic
16.10.2018 Struktura stromového patra a světelné poměry v porostech na výzkumných plochách
16.10.2018 Pěstební opatření pro zvýšení biodiversity v lesích v CHÚ (doplněno)

Spolupracujícím subjektům je tímto nabízena možnost společné presentace odborných materiálů v tomto prostoru Internetu.
Na stránkách infodatasys.cz mohou autoři článků týkajících se ekologie a zpracování dat v ekologii, biologii a v příbuzných oborech publikovat své práce. Před uveřejněním těchto prací bude zajištěna jejich nezávislá recenze. Své návrhy konzultujte s administrátorem stránek - viz kontakt, případně příslušné texty můžete zaslat prostřednictvím e-mailu.

Právní upozornění

Začátek stránky